新会县境，战国时为百越地。
秦始皇三十三年(公元前214年)，秦始皇派兵南征百越，在岭南置南海、桂林、象郡。今新会县地属南海郡。汉元鼎六年 ( 公元前111年)，把南海郡划为番禺、四会、博罗、中宿、龙川、揭阳6县，当时新会还未置县，今新会县地汉属何县，历史上有两说， 唐李吉甫著《元和郡图志》载：“新会县，本汉四会县地，隋开皇十年置新会县，属冈州”；北宋欧阳 《舆地广记》载：“新会县，汉番禺地。晋恭帝立新会郡，及置新会县”。今历史学家，多倾向唐李吉甫《元和郡图志》志，今新会县地，汉属四会县地。今出版的《中国历史的图集》，秦汉时期的古县，都无县界，但历史学家多倾向以西江磨刀门水道为界，以东属番禺，以西属四会。今新会县地，秦汉时期属古四会县地。
三国吴黄武元年(222年)，在今新会县境司前、河村一带，置平夷县。因其地汉时为越族所居，汉族战胜了越族才置县，故以平夷为县名，属交州南海郡。今新会地置县，自此始。
晋武帝太康元年(280年)，改平夷为新夷县，属广州南海郡。
南北朝，宋永初元年(420年)，分南海、新宁二郡，立新会郡，辖盆允、新夷、封平、初宾、义宁、始康6县。郡治盆允。新会之名自此始。宋文帝元嘉九年(432年)，割南海、新会、新宁三郡界上新民，立宋安(后改宋元)、新熙、永昌、始成、招集5县入新会郡。宋文帝元嘉十二年(435年)，以盆允、新夷2县界归化民立封乐县。 是年，新会郡共辖宋元、新熙、永昌、始成、招集、盆允、新夷、 封平、封乐、初宾、义宁、始康12县。齐、梁、陈3朝沿旧不变。
隋文帝开皇十年(590年)，撤新会郡，置封州。把新夷、初宾二县并入义宁县；把始康县并入封平县；把原盆允、永昌、宋元、 新熙、始成、招集6县合并为新会县，属封州。十一年封州改名允州，十三年允州改名冈州。新会由郡名改为县名自此始。
隋炀帝大业元年(605年)，撤冈州，把封乐县并入新会县，把封平县并入义宁县，俱属南海郡。
唐武德四年(621年 )，复置冈州，辖新会、封平、封乐、义宁4县。
唐贞观十三年(639年)，撤冈州，同年复置冈州，新会县属冈州，州治今新会城，故会城又名冈城。
唐天宝元年(742年)，改冈州为义宁郡。
唐乾元元年(758年)，复冈州，辖新会、义宁二县。
唐贞元未年(805年)，撤冈州，新会、义宁二县属广州。
北宋开宝五年(972年)，义宁县并入新会县，属广州。这是新会县境最大时期当时县境即宋元嘉十二年(435年)的新会郡辖12县全境，也是隋唐两代的冈州全境，故新会又名冈州。县境含今新会、台山、斗门3县、江门市城区、郊区全境和今珠海市、中山、顺德、开平、鹤山、恩平5县部分县境。
北宋开宝六年(973年)，复置义宁县，与新会同属广州。南宋绍兴二十二年(1152年)，划新会县东南濒海地区的黄梁都、乾务、古镇以及东莞、番禺、南海部分县地置香山县(今中山县)。明景泰三年(1452年)， 划新会县东北地区的白藤堡与南海县的大良堡等地置顺德县。
明成化十四年(1478年)， 划新会县西部地区的常德乡得行都与新兴、阳江两县部分县地置恩平县。明弘治十一年(1498年)， 划新会县西南地区的得行都、文章都等5都56图建新宁县(今台山县)。
清顺治六年(1649年)，划新会县西部的平康、得行、登名、古博4都与新兴、恩平两县部分位置开平县。
清雍正十年(1732年)，划西北地区的遵名、新化、古劳3都与开平县部分县地置鹤山县。
民国元年(1912年)，新会属广州府。
1914-1925年先后隶属西江善后委员公署、督办委员公署和第四区绥靖公署。
1925-1938年3月属广东省第一区行政督察专员公署。
1938年4-9月属第十区行政督察专员公署。
中华人民共和国建立后，县境变动频繁：
1949年11月，鹤山县古猛村划归新会石乔乡。
1950年5月，原属新会县的江门镇、紫茶乡、水南乡、白沙乡及北街等地，划并为专区直属江门镇。
1952年底，划出头乡归江门市。
1955年4月，划出三区横江乡的新成沙归顺德县南浦乡。
1956月1日，杜阮区的龙华里、岐水里、浮溪里、石子潭等自然村，划归江门市。
1956年10月，鹤山县南靖乡迳口村划归新会县棠下区。同年12月，崖南乡的赵家围、石屋围以西地方划归台山县。
1958年9月，顺德县均安乡的白藤、马两村划归新会荷塘区。
1959年11月，划杜阮公社的新民、丹灶、篁庄3个大队和棠下公社和篁边大队归江门市。
1964年4月，中山县横栏公社的特沙大队划归新会县大鳌区。
1965年8月，划出上横、西安两公社及大沙农场、竹银林场以及中山县部分县境置斗门县。
1977年9月，划外海公社、荷塘公社潮连片6个大队归江门市。
1983年6月实行市管县，属江门市。
1992年10月8日，经国务院批准撤县设市(县级市)，归省政府直辖，委托江门市代管，市治会城镇。
1996年7月25日，经市政府批准，三江镇虎坑、沙仔、渔业管理区撤区建场。至1996年底，全市共有会城、大泽、七堡、司前、牛湾、罗坑、小冈、双水、崖西、崖南、沙堆、古井、三江、睦洲、大鳌、荷塘、棠下、杜阮18个镇。
2003年，划杜阮镇、棠下镇、荷塘镇至蓬江区，余下以新会区并入江门市。
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