五通桥的交通运输以公路运输为主。公路交通快速便捷，较为发达，北、东、南、西四方有出境公路，通过国、省两条纵横干线与四川省的乐山、成都、自贡、内江、重庆、宜宾、西昌等地相连。区内有国道213线30公里、省道104线10.6公里、县道67.7公里、乡道223.1公里、村道756公里，路网总里程达1087公里，全区已有水泥路47条，313公里，公路密度为229.3公里/百平方公里，位于全市首位，业已形成了纵横交错的公路交通网络。水上运输以岷江为主，岷江由北向南贯穿五通桥，上接乐山市中区，下通宜宾至重庆等地，是乐山市水路大件运输和出口物资的重要通道之一。全区水路通航里程达75公里，其中四级以上通航里程35公里。
五通桥就近火车站——乐山站。位于成昆线k136+635米处，车站货运营业办理限制为圈农，货场总面积65014平方米，该站货运年设计能力为134.47万吨。
设有货物线5条，货1线有效长363米，仓库两座，使用面积1875平方米，低平货位183米。货2线为门吊作业线，门吊最大起重能力36吨，有效长240米。货3线有效长100米，低平货位80米。货4线为新门吊作业线，有效长130米，门吊最大起重能力40吨，低平货位100米。货5线有效长150米，仓库使用面积960平方米，高站台使用面积720平方米。
五通桥中心汽车站，设立有售票处（窗）、候车区（室）、厕所，配备时钟、座椅、供应饮用水、公布班次时刻表、里程票价表、营运线路图、旅客须知，张贴禁运、限运物品宣传图，设置旅客意见簿、旅客留言牌、公告栏询问处等，还配备保健药箱、广播室、电话、行李托运指引等。
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