福田区历史悠久，福田地域历来为宝安（新安）县地。明时属新安县城归城乡去都，清时属新安县官富司辖地。
民国时期到解放初期福田地域属宝安县第二区沙头乡。
1979年3月宝安县改为深圳市，同年4月成立罗湖区，辖福田、附城两个公社。1980年8月深圳、沙头角、附城、福田、南头、蛇口、盐田公社划为深圳经济特区。1981年10月成立罗湖区政府，福田公社划分为福田、南园2个办事处。1983年6月根据深府[1983]118号文件精神，特区内设置罗湖、上步、南头、沙头角4个办事处，为市政府派出的相当县级的办事机构，上步区办事处管辖红岭路以西至车公庙以东区域，包括上步、福田2个街道办事处，上步区办事处驻福田。同年10月根据深府[1983]194号文件通知，上步区设园岭、南园、福田、沙头、梅林5个街道办事处。1985年3月根据深府办[1985]88号文件通知，上步区办事处改称为“深圳市人民政府上步管理区”。区内辖福田、南园、沙头、园岭、梅林5个办事处，25个居委会，14个村委会，45个自然村，土地面积78.8平方公里。
1989年5月根据深府[1989]152号文件批复，上步管理区增设华富、香蜜湖2个街道办事处。1990年10月经国务院批准深圳市设立福田区、罗湖区和南山区（县级建制）。福田区管辖园岭、南园、福田、沙头、梅林、华富和香蜜湖街道办事处。区人民政府驻深南中路，原上步管怄相应撤销。
2002年辖7个街道（南园 园岭 华富 福田 沙头 梅林 香密湖），116个居委会。
2004年辖8个街道。
南园街道：辖巴登、滨江、沙埔头、南园、园西、锦龙、南华、赤尾、滨河9个社区居委会。
园岭街道：辖红荔、园东、通新岭、福强、荔村、长城、上林、南天、鹏盛9个社区居委会。
福田街道：辖福华、福安、圩镇、口岸、福山、福民、水围、渔农、岗厦、海滨、福保、福田、皇岗13个社区居委会。
沙头街道：辖新沙、石厦、新洲、沙咀、下沙、上沙、新华、益田、金城、天安、新港、金地、沙尾、明月、翠湾15个社区居委会。
香蜜湖街道：辖竹林、香安、香梅、香岭、竹园、农园、香蜜7个社区居委会。
梅林街道：辖上梅、新兴、下梅、梅丰、梅京、梅亭、梅都、龙尾、孖岭、新阁、梅林一村12个社区居委会。
莲花街道：辖福中、彩虹、莲花北、景田、景华、紫荆、梅岭、狮岭、康欣、梅富、福新11个社区居委会。
华富街道：辖梅岗、华山、华红、黄木岗、华航、田面、新田、莲花三村、莲花二村、莲花一村10个社区居委会。
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