虎门大桥的开通使南沙地区成为联系珠江口东西两岸城市群的重要通道，使之从原来的交通尽端变成交通枢纽，战略性地提升了本地区作为整个珠江三角洲地区交通枢纽的地位。近年来建成的“华南路，迎宾路，南沙大道”、“广深高速公路、虎门大桥、京珠高速公路南段”两个走廊，对南沙地区交通发展具有较大的促进作用，加强了南沙地区与广州、珠江口东西两岸城市的交通联系。
广州地铁三号线延长线由市桥向东延伸至广州新城（规划与地铁四号线交汇后，再向南延至南沙国际客运港。南沙地区通过三号线与机场快轨线在广州东站衔接换乘，可直达广州新白云国际机场。
东莞火车站——一个在广九线、大京九线、广梅汕线等铁路线上新崛起的重要枢纽大站。东莞站原名常平站，1997年底经铁道部批准，更名为东莞站，东莞站在京九线上的地位正日益提升。
南沙区就近汽车站—番禺汽车客运站。
番禺汽车客运站位于广州市番禺区石基镇清河东路傍西村路段，总占地面积93,331平方米，是一座现代化、多功能、集长短途公路客运五福与城区公共交通、轨道交通接驳服务及旅游服务于一提的规范性综合型站场，其设计能力为日发送旅客量45,000人次，日发班量3,500班，经营线路通达广东省内大部分的确和港澳地区、广西、湖南、湖北、重庆、四川、贵州、江西、河南、福建、浙江等各个省份的主要县市，与此同时，覆盖到番禺区各个镇的客运线路、多条配套公交班线为旅客的转乘提供更大的方便。
南沙新客运港位于珠江入海口河段西岸，虎门大桥以南约1.6公里处，港口距香港48海里，距澳门41海里，从新客运港乘高速客船前往香港中港城只需72分钟。新客运港设计标准为年客运量160万人次，设计旅客聚集量1600人，为国际客运港。
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